I級(jí)生物安全柜通過使用HEPA過濾，定向和層流氣流為用戶/操作員，環(huán)境和產(chǎn)品/樣品提供保護(hù)。出于無菌的目的，對于尺寸為0.3微米的顆粒，HEPA過濾器通常額定功率為99.99 +％。
 
典型的微生物程序通常利用本生燈燃燒器或其他明火來消毒和/或減少交叉污染。
 
由于以下幾個(gè)原因，建議不要在生物安全柜內(nèi)使用這種明火：
 
（1）II類生物安全柜通過將層流（以恒定速度 - 無湍流的單向流動(dòng)的空氣量）向下傳送到機(jī)柜的工作區(qū)域，通過明火加熱空氣來維護(hù)產(chǎn)品保護(hù)導(dǎo)致空氣逆著層流下降而上升，產(chǎn)生湍流; 從而消除產(chǎn)品保護(hù)。
 
（2）明火也具有熔化將HEPA過濾介質(zhì)固定在其框架上的粘合劑的能力。這破壞了HEPA過濾器的有效性，從而導(dǎo)致正壓通風(fēng)口中的容器損失。
 
（3）后，如果火焰熄滅，閥門不關(guān)閉，可燃?xì)怏w會(huì)以穩(wěn)定的速度流入柜體。對于A2中生物安全柜中70％的空氣被再循環(huán)的情況，可燃?xì)怏w的濃度可能會(huì)爆炸，并且不僅對生物安全柜造成嚴(yán)重威脅，而且對使用者和實(shí)驗(yàn)室造成嚴(yán)重威脅。
 
疾病控制和預(yù)防中心（CDC）和國家衛(wèi)生研究院（NIH）在該出版物中也提到了這一點(diǎn)：
在生物安全柜工作時(shí)，可以采取多種措施來減少材料交叉污染的可能性。打開的管子或瓶子不應(yīng)垂直放置。研究人員使用陪替氏培養(yǎng)皿和組織培養(yǎng)板時(shí)應(yīng)將蓋子放在開放的無菌表面上方，以盡量減少向下空氣的直接沖擊。瓶或管帽不應(yīng)放在毛巾上。應(yīng)盡快重新填寫或覆蓋項(xiàng)目。生物安全柜內(nèi)無微生物的環(huán)境中不需要明火。在敞開的長凳上，燃燒培養(yǎng)皿的頸部將產(chǎn)生向上的氣流，防止微生物落入管或燒瓶中。然而，生物安全柜中的明火產(chǎn)生湍流，擾亂了HEPA過濾空氣供給工作表面的模式。當(dāng)被認(rèn)為是必要的時(shí)候，可以使用配備指示燈的觸板微型燃燒器按需提供火焰。內(nèi)部機(jī)柜空氣干擾和熱量累積將被小化。工作完成后，燃燒器必須關(guān)閉。小型電爐“爐”可用于凈化細(xì)菌環(huán)和針，并優(yōu)于生物安全柜內(nèi)的明火。應(yīng)盡可能使用一次性或可回收的無菌環(huán)。